رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی درگذشت آیت‌الله محفوظی را تسلیت گفتند. 

در پیام رهبر انقلاب اسلامی آمده است:

بسم الله الرحمن الرحیم

درگذشت عالم بزرگوار آیت‌الله آقای حاج شیخ عباس محفوظی رحمةالله‌علیه را به خاندان محترم و همه‌ی دوستان و ارادتمندان و شاگردان ایشان تسلیت عرض می‌کنم. این عالم جلیل از شاگردان و یاران دیرین امام راحل رضوان‌الله‌علیه و از وفاداران به آن بزرگمرد تا آخر عمر با برکت خود بودند. رحمت الهی و علو درجات ایشان را از خداوند مسألت می‌کنم.